Estava eu tentando converter uns vídeos para o meu humilde celular e assistir enquanto estivesse viajando. Após uma longa procura googlada consegui converter, então compartilho o código:

ffmpeg -i ~/Vídeos/Alem\ da\ Imaginacao/Ep13.rmvb -acodec libfaac -ab 128kb -vcodec mpeg4 -b 1200kb -mbd 2 -cmp 2 -subcmp 2 -s 320x180 zone13.mp4


-acodec libfaac => Codec de áudio para mp4.
-ab 128kb => Qualidade do áudio.
-vcodec mpeg4 => Codec do vídeo.
-s 320x180 => Resolução do vídeo.